收集到的废气在适宜的条件下通过长满微生物的火山岩滤料，气味物质先被滤料吸收，然后被滤料上的微生物氧化分解，完成废气的除臭过程。
固体载体上生长的微生物承担了物质转换的任务，因为微生物生长需要足够的有机养分，所以固体载体需要具有高的有机成分。要使微生物保持高的活性，还需要为之创造一个良好的生存条件，比如：适宜的湿度、pH值、氧气含量、温度和营养成分等。环境条件变化会影响微生物的生长繁殖，因此在试运行时或改变工况时要考虑生物过滤池会有一个适应期。
生物过滤池的主要部分是滤料。一种好的滤料需要满足：容许生长的微生物种类多;供微生物生长的表面积大;营养成分合理(N、P、K和痕量元素);吸水性好;自身的气味少;吸附性好;结构均匀孔隙率大;价格便宜;腐烂慢(运行时间长、养护周期长)。滤料本身还有机养分，当过滤池暂停运行时，微生物可以利用火山岩滤料的有机成分继续维持生命活动。
